木制窗户虽然具有美观、自然、保温隔热性能好等优点，但也存在一些不可忽视的缺点。以下是木制窗户的一些主要缺点：

易受潮、变形：木材容易吸收水分，在潮湿环境下容易受潮、膨胀、变形，甚至开裂。这会影响窗户的密封性和使用寿命。

需要定期维护：为了保持木制窗户的美观和性能，需要定期进行维护，如打蜡、油漆等。如果维护不当，窗户可能会褪色、脱落，影响整体美观。

防火性能差：木制窗户的防火性能相对较差，一旦遇到火灾，木材容易燃烧，增加火灾的风险。

易受虫害侵扰：木材容易受到白蚁、蛀虫等虫害的侵扰，导致窗户损坏。特别是在潮湿、通风不良的环境中，虫害问题更为严重。

耐腐蚀性差：木材对酸碱等化学物质的抗腐蚀性较差，容易受到腐蚀和损坏。如果窗户安装在容易受到化学物质污染的环境中，如化工厂附近，可能会加速木材的腐蚀。

价格差异大：不同种类的木材价格差异较大，导致木制窗户的价格范围较广。一些高档木材如橡木、柚木等价格昂贵，而一些普通木材则价格相对亲民。但即使是高档木材，也难以完全避免上述缺点。

安全性相对较低：与金属或塑料等材质相比，木材的强度和硬度较低，抗风压、抗撞击等能力较弱。在恶劣天气或人为破坏的情况下，木制窗户可能更容易受损。

综上所述，虽然木制窗户具有美观、自然等优点，但也存在易受潮、变形、需要定期维护、防火性能差、易受虫害侵扰、耐腐蚀性差以及价格差异大等缺点。在选择窗户时，需要根据实际需求和环境条件进行综合考虑。